68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3022 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  100 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  39.86 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  33.56 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.69 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  31.88 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.29 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  32.65 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.88 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  30.83 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  35.11 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  29.79 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  28.19 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.71 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.93 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  26.06 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.71 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  26.83 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  29.25 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  28.08 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  29.93 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  44.44 
 
 		 198 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  33.09 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  30.41 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  26.81 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.68 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  26.53 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  27.21 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  27.97 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  26.21 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  33.68 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  30.85 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  42.59 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  30.85 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  26.24 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  29.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  24.44 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  44.44 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  36.84 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  27.55 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  26.95 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  28.8 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  31.03 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  30.77 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  30.37 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  37.04 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  29.53 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  27.34 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.21 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3834  DoxX family protein  29.25 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3783  DoxX family protein  29.25 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  32.12 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  27.78 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  27.55 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  31.33 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  23.97 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  37.04 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  26.53 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  42.59 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  27.34 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  31.43 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  35.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  35.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  26.53 
 
 		 183 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  35.58 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  35.58 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  35.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  35.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  35.58 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>