84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2820 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  60.32 
 
 		 133 aa  156  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  58.73 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  60 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  56.92 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  55.74 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  58.06 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  61.48 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  57.14 
 
 		 140 aa  140  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  56.15 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  52.46 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  51.54 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  51.52 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  51.26 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  57.81 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  50.82 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  49.61 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  49.23 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  51.79 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  54.92 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  48.03 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  51.15 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  46.51 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  47.06 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  48.85 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  48.85 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  48.85 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  45.31 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  44.44 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  44 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  44 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  45.24 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  48.44 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  46.83 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  42.22 
 
 		 136 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  42.74 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  44.44 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  40.98 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  43.2 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  41.86 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  41.94 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  41.46 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  40.52 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  43.94 
 
 		 185 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  38.66 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  36.29 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  31.75 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  34.38 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.99 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.56 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.43 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.71 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.28 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  31.43 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  34.31 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3658  DoxX family protein  30.47 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  29.41 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  34.13 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  31.36 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  28 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  38.98 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  29.37 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.84 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  30.43 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  31.4 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  31.4 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  31.09 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.41 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  28.06 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  37.04 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  37.04 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3675  DoxX family protein  29.86 
 
 		 145 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136141  normal  0.200959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  30.15 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  37.04 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.3 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  31.93 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  31.85 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  35.59 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  23.97 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  27.74 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  29.79 
 
 		 164 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  34.57 
 
 		 137 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>