104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1799 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  99.49 
 
 
197 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  98.98 
 
 
197 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  98.48 
 
 
197 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  86.29 
 
 
197 aa  348  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  86.29 
 
 
197 aa  348  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  85.79 
 
 
202 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  84.77 
 
 
197 aa  315  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  78.65 
 
 
198 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  71.2 
 
 
197 aa  293  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  78.09 
 
 
198 aa  292  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  70.41 
 
 
197 aa  289  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  74.74 
 
 
195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  75.39 
 
 
196 aa  267  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  69.23 
 
 
196 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  62.5 
 
 
216 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  63.98 
 
 
196 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  63.44 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  55.61 
 
 
204 aa  223  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  61.26 
 
 
199 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  47.73 
 
 
232 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.94 
 
 
147 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  28.65 
 
 
144 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  40.4 
 
 
164 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  41.67 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.89 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  34.44 
 
 
133 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  34.44 
 
 
133 aa  55.5  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.4 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.1 
 
 
148 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.68 
 
 
154 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.11 
 
 
148 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  33 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  34.74 
 
 
185 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  34.74 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.87 
 
 
134 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  33.33 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.02 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  39.78 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.28 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  37.5 
 
 
133 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  35.16 
 
 
183 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  35.16 
 
 
183 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  34.07 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  39.29 
 
 
146 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  34.78 
 
 
137 aa  48.9  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  28.42 
 
 
151 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  34.62 
 
 
141 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  37.35 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.19 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  46.43 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  38.6 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  38.6 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  38.6 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  42.71 
 
 
148 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  36.78 
 
 
135 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  37.74 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  34.69 
 
 
147 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  28.48 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.19 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  37.08 
 
 
136 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  34.52 
 
 
137 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  33.33 
 
 
137 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  40.21 
 
 
147 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  34.57 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  32.98 
 
 
123 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  40.51 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  38.81 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  31.28 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  33.66 
 
 
173 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  34.26 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  40.45 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  32.2 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.38 
 
 
148 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  29.57 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  30.5 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  31.11 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  29.36 
 
 
141 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  40.51 
 
 
155 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  34.91 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.94 
 
 
139 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  37.93 
 
 
131 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.63 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  32.69 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  41.27 
 
 
144 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  34.26 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  31.71 
 
 
145 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  34.26 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  34.26 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.76 
 
 
127 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  28.44 
 
 
171 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  35.23 
 
 
155 aa  42  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  35.23 
 
 
164 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  34.18 
 
 
181 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  35.23 
 
 
164 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  36.11 
 
 
144 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>