61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01645 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01645  DoxX  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  64.29 
 
 		 216 aa  258  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  61.14 
 
 		 197 aa  239  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  58.21 
 
 		 198 aa  237  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  59.7 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  57.21 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  57.21 
 
 		 197 aa  227  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  57.21 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  57.95 
 
 		 197 aa  224  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  55.61 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  59.24 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  56.12 
 
 		 197 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  56.12 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  56.12 
 
 		 197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  61.22 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  56.5 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  58.08 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  46.54 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  52.87 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  52.3 
 
 		 196 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  51.72 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  38.04 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  39.77 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  33.7 
 
 		 133 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  33.7 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.48 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  37.93 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  46.48 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.5 
 
 		 134 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.86 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  28.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  41.46 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  41.46 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  41.46 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  38.04 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  34.58 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  37.96 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.43 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  32.91 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.04 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  45.28 
 
 		 149 aa  45.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.31 
 
 		 144 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  29.89 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  34.09 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.52 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.94 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.91 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.76 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  33.96 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  39.68 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  38.46 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  33.68 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  35.14 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.98 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.54 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  35.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  38.68 
 
 		 147 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  36.19 
 
 		 154 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>