30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4294 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  100 
 
 
181 aa  342  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  99.45 
 
 
181 aa  342  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  99.45 
 
 
181 aa  342  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  65.82 
 
 
198 aa  210  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2130  DoxX family protein  61.97 
 
 
183 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.354782  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  35.65 
 
 
405 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  28.49 
 
 
279 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3737  DoxX family protein  47.06 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  34.72 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  26.32 
 
 
296 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  32.41 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  28.5 
 
 
378 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  31.47 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  31.47 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  34.85 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  27.68 
 
 
297 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  41.46 
 
 
204 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.34 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.22 
 
 
154 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30.07 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.46 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  28.46 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  28.77 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.47 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  32.39 
 
 
134 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  33.33 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  27.33 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  28.06 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  30.95 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  34.52 
 
 
283 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>