56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0476 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  100 
 
 
134 aa  264  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  46.51 
 
 
128 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  43.61 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  44.78 
 
 
149 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  44.03 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  42.64 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  48.28 
 
 
114 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  43.31 
 
 
131 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  43.75 
 
 
140 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  44.09 
 
 
134 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  38.64 
 
 
136 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  43.41 
 
 
138 aa  103  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  40.31 
 
 
127 aa  101  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  39.23 
 
 
130 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  39.84 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  39.53 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  43.28 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  42.11 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  41.48 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  38.76 
 
 
144 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  38.76 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  37.88 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  41.59 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  38.35 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  37.59 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  35.34 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  34.88 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  43.85 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  42.24 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  40.17 
 
 
131 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  35.34 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  43.75 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  37.96 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  37.04 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  31.86 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  33.33 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  31.34 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.09 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  36.73 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  36.73 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  29.92 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  32.86 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  32.86 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  32.06 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  32.86 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.36 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.45 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  29.17 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  34.57 
 
 
188 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  33.64 
 
 
137 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  34.57 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.37 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  30.77 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  34.81 
 
 
211 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>