20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4574 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  100 
 
 
198 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2130  DoxX family protein  72.22 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.354782  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  65.84 
 
 
181 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  65.84 
 
 
181 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  65.84 
 
 
181 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  31.07 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  30.06 
 
 
296 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  31.67 
 
 
378 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  29.94 
 
 
279 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  34.96 
 
 
405 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  32.26 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  31.45 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  31.45 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  30.83 
 
 
198 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3737  DoxX family protein  37.29 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.33 
 
 
148 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  31.82 
 
 
137 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  32.06 
 
 
134 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  32.28 
 
 
128 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  34.94 
 
 
142 aa  41.2  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>