67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1137 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  46.76 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  43.54 
 
 		 171 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  41.98 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2006  DoxX family protein  51.06 
 
 		 160 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  52.52 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2400  DoxX family protein  51.45 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3295  DoxX family protein  51.45 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1906  DoxX family protein  51.06 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.646959  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  34.48 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  35.82 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  35.2 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  31.65 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  34.03 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.85 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  31.03 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  31.72 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  36.78 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  36.79 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  31.47 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  33.33 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  34.53 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  30.66 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  34.38 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  31.34 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  36.67 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  36.9 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  28.89 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  32.35 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  29.2 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.47 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.11 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  35 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.37 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  38 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  26.57 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  32.54 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  29.13 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  28.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.88 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  29.71 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  35 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  33.96 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  36.36 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  33.82 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30.15 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  31.11 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  26.32 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.82 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  30.37 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.55 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  29.63 
 
 		 145 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  27.74 
 
 		 147 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  31.78 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  30.37 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  33.62 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  31.75 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  26.57 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  30.37 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.15 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  30.66 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  24.52 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>