44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5146 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  100 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  79.74 
 
 		 167 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  69.59 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  61.07 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  50 
 
 		 174 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  49.62 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  49.18 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  41.61 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  44.53 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  36.49 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  38.12 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  41.27 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  42.66 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  42.24 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  37.21 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  39.42 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  38.05 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  40.29 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  41.98 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  39.16 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  39.44 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  31.65 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  28.76 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  37.4 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  32.12 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  31.85 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  31.45 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  34.4 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  32.09 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  28.85 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  33.08 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  29.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  29.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.45 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  30.6 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  29.31 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  35.25 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.2 
 
 		 752 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.2 
 
 		 730 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  25.42 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>