68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2637 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  100 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  46.76 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  44.3 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  46.67 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  41.33 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2006  DoxX family protein  39.74 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2400  DoxX family protein  39.33 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3295  DoxX family protein  39.33 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  36.76 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1906  DoxX family protein  37.82 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.646959  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  33.33 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  43.75 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.22 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  38.26 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  40.74 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.39 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.29 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  40.24 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  40 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.83 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  38.27 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  28.85 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  37.39 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  35.65 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  28.85 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  34.78 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  34.78 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  29.11 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  33.9 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  28.57 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  32.2 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  28.66 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  28.29 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  29.21 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.57 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  31.07 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  32.09 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  29.2 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  38.16 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  34 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  30.09 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  25.35 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  29.86 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  29.5 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  33.9 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  29.5 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  30.51 
 
 		 144 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.82 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  29.5 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.51 
 
 		 172 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  35.66 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.8 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  30.95 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  29.03 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  28.78 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  34.45 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  27.93 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  32.26 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  27.69 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>