79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2754 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  258  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  68.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  67.5 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  65 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  59.2 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  60.48 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  63.93 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  60.32 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  56.15 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  60.48 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  57.26 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  59.2 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  54.47 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  53.03 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  48.09 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  53.38 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  48.8 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  48.84 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  44.88 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  53.17 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  51.67 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  42.19 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  50 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  49.61 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  49.61 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  50 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  40.91 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  47.06 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  52.42 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  39.68 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  46.97 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  44.78 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  44.78 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  44.78 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  37.4 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  36.8 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  42.65 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  36.64 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  44.17 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  36.92 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  34.35 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  34.68 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  40.68 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  37.82 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.5 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  35.82 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  38.46 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  32.81 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  36.72 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.99 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.5 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.75 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  32.54 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  37.61 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.75 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.08 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  30.4 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  32.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  35.8 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.4 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  30.25 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.71 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.15 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  39.53 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  27.05 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  31.75 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  35.38 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  31.25 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  30.08 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  39.29 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.23 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  29.03 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.01 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  29.55 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.54 
 
 		 172 aa  40.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  29.27 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  33.33 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  36.26 
 
 		 143 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>