63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2663 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  100 
 
 		 118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  55.45 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  82.81 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  82.81 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  85.94 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  81.25 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  84.38 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  84.38 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  81.25 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  48.62 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  44.95 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  71.43 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  44.95 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  66.67 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  69.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  62.9 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  62.9 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  42.5 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  62.9 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  60.94 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  60.66 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  53.97 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  53.12 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  72.55 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  53.12 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  67.92 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  67.92 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  57.38 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  56.67 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  66.04 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  53.33 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  52.46 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  58.33 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  45.45 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  52.38 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  57.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  46.77 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  36.28 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  37.76 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  46.43 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  60 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  41.27 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  32.79 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  37.88 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  34 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  35.37 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  34.94 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  34.94 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  44 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  29.73 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  44.44 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  33.33 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  33.33 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  33.33 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.06 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>