41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5936 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  100 
 
 		 172 aa  344  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  69.59 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  59.01 
 
 		 167 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  57.46 
 
 		 141 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  45.51 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  53.85 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  50 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  40.48 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  43.88 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  39.74 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  39.66 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  45.54 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  41.1 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  43.26 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  42.4 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  44.35 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  39.71 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  43.55 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  35.42 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  36.25 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  35.03 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  29.45 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  30.86 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  32.06 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  32.28 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  28.04 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  30.37 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  30.37 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  30.66 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  31.21 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.61 
 
 		 730 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.61 
 
 		 752 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  30.65 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  32.14 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  28.29 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0374  TQO small subunit DoxD  29.45 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  33.06 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  30.23 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.83 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>