51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1240 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  71.24 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  54.36 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  51.53 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  51.47 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  52.89 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  42.04 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  52.41 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  43.26 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  52.17 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  49.35 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  40 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  44.08 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  40.48 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  41.5 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  36.53 
 
 		 167 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  37.66 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  36.49 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  34.34 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  34.34 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  36.71 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  38.24 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  35 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  37.68 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  34.04 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  34.69 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  32.64 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  38.68 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  32.62 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 738 aa  58.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 738 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  32.12 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  35.21 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1725  DoxX  30.22 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 		 730 aa  47.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.14 
 
 		 752 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  27.92 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  32.65 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2821  hypothetical protein  27.68 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  26.36 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  33.78 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  33.78 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  33.93 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  28.89 
 
 		 123 aa  41.2  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.89 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  35.71 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  35.53 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>