35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02374 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  321  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  81.41 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  81.41 
 
 		 156 aa  230  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  50.83 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  46 
 
 		 152 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  40.65 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  48.85 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  41.18 
 
 		 151 aa  98.2  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  39.57 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  50.43 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  44.19 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  44.19 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  36.03 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  33.54 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  34.64 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  32.65 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  35.07 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  35.2 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  30.08 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  35 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  31.65 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  40.74 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  43.06 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  32.14 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  27.88 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  32.46 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  35.56 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  29.82 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  37.72 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  35.78 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  36.52 
 
 		 155 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  41.67 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  41.67 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  29.22 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>