37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1432 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  100 
 
 		 175 aa  338  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  67.59 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  65.49 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  59.09 
 
 		 141 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  50 
 
 		 172 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  46.43 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  49.18 
 
 		 154 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  43.18 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  44.74 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  40.15 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  36.5 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  37.68 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  41.58 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  47.15 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  46.34 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  39.34 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  45.53 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  31.69 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  40.46 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  44.26 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  41.32 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  33.58 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  33.86 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  34.81 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  32.43 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  28.93 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  35.92 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  29.32 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  39.53 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  31.39 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.11 
 
 		 730 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.11 
 
 		 752 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  31.53 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  38.2 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>