56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3394 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  276  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  64.52 
 
 		 174 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  61.36 
 
 		 167 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  59.09 
 
 		 175 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  57.46 
 
 		 172 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  61.07 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  60.8 
 
 		 165 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  49.3 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  46.27 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  42.28 
 
 		 175 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  40.43 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  37.66 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  37.68 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  46.28 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  37.78 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  36.43 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  50 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  35.82 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  42.06 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  35.56 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  41.35 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  35.56 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  31.65 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  42.22 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  33.33 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  31.62 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  39.42 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  35.25 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  35.25 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  35.43 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  33.82 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  33.81 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  28.68 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  35.38 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  36.56 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  35.23 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  34.09 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  35.96 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  31.62 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  34.95 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  35.23 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  32.35 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  28.57 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  29.36 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  32.95 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0836  TQO small subunit DoxD  27.66 
 
 		 174 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  30.28 
 
 		 197 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  26.87 
 
 		 148 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.78 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  28.47 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  30.56 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  30.56 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  27.34 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>