58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4788 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  49.28 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  47.41 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  42.04 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  44.08 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  55.47 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  54.21 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  43.2 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  53.23 
 
 		 128 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  52.71 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  45 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  48.92 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  41.94 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  40.94 
 
 		 151 aa  94  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  43.61 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  49.19 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  37.6 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  37.6 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  39.13 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  45.6 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  38.33 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  50 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  38.65 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  41.27 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  37.68 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  41.1 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  34 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  37.9 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  36.3 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  45.05 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  29.87 
 
 		 738 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  30.52 
 
 		 738 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  36.72 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  31.69 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  27.78 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.72 
 
 		 730 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.93 
 
 		 752 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  28.46 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  30.51 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  33.93 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  33.93 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  35.07 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  37.78 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  30 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  31.82 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  31.48 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  29.75 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  29.57 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  25.35 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  29.46 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  31.73 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  33.08 
 
 		 140 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  22.73 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  32 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0771  DoxX family protein  27.17 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.135412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  34.88 
 
 		 137 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>