53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002082 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  100 
 
 		 151 aa  303  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  87.42 
 
 		 151 aa  279  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  68.09 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  49.35 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  47.2 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  48.44 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  48.44 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  47.93 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  45 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  40.94 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  49.55 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  39.57 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  38.13 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  39.07 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  38.46 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  38.46 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  34.44 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  42.34 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  33.33 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  37.5 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  32.64 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  31.68 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  31.25 
 
 		 738 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  28.67 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  36.8 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  38.78 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 		 730 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  31.62 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32 
 
 		 752 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  33.58 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  32.12 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  36.84 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  32.28 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  38.76 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  38.76 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  32.31 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  35.57 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  29.23 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  28.89 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0428  hypothetical protein  33.68 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  32.06 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  29.14 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  34.62 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  29.55 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  29.37 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  29.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  29.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  29.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  29.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  29.55 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  29.55 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  29.55 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>