60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0702 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  307  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  99.35 
 
 
154 aa  306  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  49.61 
 
 
151 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  48.44 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  45 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  44.29 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  40.85 
 
 
160 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  40.44 
 
 
156 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  43.8 
 
 
152 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  38.58 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  46.96 
 
 
155 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  44.19 
 
 
162 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  42.75 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  42.75 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  34.52 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  35.88 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  34 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  38.71 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  34.53 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  35.66 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  35.56 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.47 
 
 
752 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  30.37 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  36.73 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  38.03 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  33.58 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  34 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  34.65 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  29.93 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  33.33 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.71 
 
 
730 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  35.38 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  32.32 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  35.38 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  33.64 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  34.55 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  34.29 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  30 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  29.86 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  29.41 
 
 
197 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  29.41 
 
 
202 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  28.78 
 
 
738 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  28.32 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  28.78 
 
 
738 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  28.57 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  28.68 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  27.45 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  27.19 
 
 
133 aa  43.9  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  31.86 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  29.03 
 
 
137 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  32.8 
 
 
204 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30 
 
 
131 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  30.69 
 
 
197 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  28.89 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  28.89 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  28.1 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  29.6 
 
 
129 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>