81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1531 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  77.66 
 
 		 197 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  74.23 
 
 		 198 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  74.48 
 
 		 197 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  73.96 
 
 		 197 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  74.35 
 
 		 202 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  71.2 
 
 		 197 aa  293  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  75.14 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  75.92 
 
 		 196 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  71.88 
 
 		 197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  71.35 
 
 		 197 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  70.31 
 
 		 197 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  75.26 
 
 		 195 aa  273  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  76.02 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  71.81 
 
 		 197 aa  257  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  58.76 
 
 		 216 aa  241  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  61.14 
 
 		 204 aa  239  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  59.49 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  58.46 
 
 		 196 aa  224  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  59.49 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  44.44 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  27.57 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  26.42 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  38.95 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  38.95 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  37.89 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  36.17 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  36.17 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  29.63 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  34.1 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  35.79 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.82 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  32.29 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  32.29 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  34.78 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  28.95 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  29.94 
 
 		 149 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  33.75 
 
 		 133 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.96 
 
 		 127 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  35.96 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  36.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  27.61 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.23 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.78 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.74 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.09 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  35.87 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  35.58 
 
 		 141 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  25.14 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  31.09 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  38.27 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  34.04 
 
 		 123 aa  48.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  31.58 
 
 		 143 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  35.29 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  32.73 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  37.78 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  31.48 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  40 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  39.13 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  49.02 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  36.47 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  32.69 
 
 		 136 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4028  DoxX family protein  32.1 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  30.34 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.96 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  35 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  28.7 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.57 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  35.24 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  30.51 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  26.09 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.71 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  29.1 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  28.57 
 
 		 175 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4558  DoxX family protein  32.1 
 
 		 135 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  37.04 
 
 		 153 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  42.86 
 
 		 137 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  35.16 
 
 		 144 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  28.57 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>