29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2173 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  100 
 
 		 161 aa  318  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  48.65 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1322  DoxX  51.27 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  48.59 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13521  hypothetical protein  54.35 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  39.73 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  36.59 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  29.75 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  27.59 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.52 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  29.14 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.1 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  29.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  29.87 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  30.34 
 
 		 197 aa  44.3  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  28.46 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  31.41 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  33.64 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  29.06 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  31.46 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  28.21 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  37.66 
 
 		 144 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  40.3 
 
 		 138 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  31.33 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  37.5 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1877  hypothetical protein  28.28 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.66 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  28.57 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  28.12 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>