49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13521 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13521  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  293  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  50.68 
 
 
164 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  48.91 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1322  DoxX  53.52 
 
 
145 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  44.37 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  54.35 
 
 
161 aa  111  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.82 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  29.85 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  34.83 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  30.71 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.66 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  31.65 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  29.5 
 
 
143 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  27.48 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.91 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  28.47 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  28.68 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  28.87 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  27.66 
 
 
133 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.59 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  29.85 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  25.93 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  28.78 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  29.93 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  32.17 
 
 
239 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  28.17 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  27.27 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  31.39 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  27.59 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  27.94 
 
 
133 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  30.43 
 
 
149 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  30.36 
 
 
137 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  38.24 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  27.94 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  25.55 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  32.74 
 
 
198 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  31.37 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  31.37 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  32.12 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  26.06 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.96 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  36.17 
 
 
141 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  26.12 
 
 
140 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  28.57 
 
 
164 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  31.39 
 
 
145 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  27.54 
 
 
133 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>