88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1322 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1322  DoxX  100 
 
 		 145 aa  284  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  54.61 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  49.29 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  47.97 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  51.27 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13521  hypothetical protein  53.15 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.92 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  35.94 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.97 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  35.43 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.72 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.38 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.34 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  30.08 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.25 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  31.16 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  34.56 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  33.57 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.72 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.78 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  31.72 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  31.97 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  33.57 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  33.57 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  29.71 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.08 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.01 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.43 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  33.57 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  31.69 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  32.81 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  35.34 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  29.23 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  31.85 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  30.47 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  37.5 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  32.87 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  28.99 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  36.97 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  28.97 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  30.3 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  28.77 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  32.03 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  31.69 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  31.69 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  31.88 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  30.33 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  27.48 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  31.69 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.71 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  35.79 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  33.83 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  27.4 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  32.59 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  29.58 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  25.93 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  30.15 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  26.71 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  36.14 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  31.75 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  32.71 
 
 		 281 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.77 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  29.46 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  29.1 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  33.61 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  37.76 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  27.48 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  28.26 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  32 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  32.53 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  31.75 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  32.53 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  31.75 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  31.75 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  29.7 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  41.1 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  30.71 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  29.5 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  26.57 
 
 		 185 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  32.74 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  31.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  27.2 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  30.48 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  27.27 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  30.77 
 
 		 153 aa  40  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  25.17 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  29.85 
 
 		 378 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  24.83 
 
 		 132 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>