89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0499 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  100 
 
 		 134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  88.55 
 
 		 133 aa  234  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  87.02 
 
 		 133 aa  233  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  73.17 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  65.65 
 
 		 131 aa  177  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  58.14 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  65 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  55.74 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  59.68 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  56.3 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  59.68 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  54.17 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  61.29 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  53.33 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  54.84 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  58.2 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  50.81 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  59.48 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  53.33 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  48.76 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  47.9 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  47.01 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  51.2 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  48.85 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  47.01 
 
 		 136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  50 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  49.19 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  40.94 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  47.62 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  41.73 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  42.5 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  40 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  45.97 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  40.16 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  41.04 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  44.17 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  44.17 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  44.17 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  43.65 
 
 		 185 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  44.83 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  39.23 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  41.88 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  40.52 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  38.35 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  40 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  34.45 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.71 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.91 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.11 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.17 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  34.17 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.82 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  32.23 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.64 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  31.71 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  32 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  31.01 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28.03 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  33.06 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  30.51 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  29.29 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  29.92 
 
 		 180 aa  43.9  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  42.5 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  29.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  29.37 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  26.67 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  32.28 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  30.43 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  31.43 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  29.55 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  28.35 
 
 		 150 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  34.74 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  31.01 
 
 		 128 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  31.75 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  31.15 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  30 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  32.23 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  29.5 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  32.5 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  28.69 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  28.7 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.27 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  37.19 
 
 		 150 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.54 
 
 		 148 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>