74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0038 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  255  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  87.3 
 
 		 135 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  71.09 
 
 		 133 aa  184  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  71.09 
 
 		 133 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  65.65 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  63.08 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  60.32 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  60.16 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  58.06 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  61.34 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  55.47 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  55.2 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  59.2 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  54.92 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  54.4 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  57.38 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  50.78 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  51.24 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  55.2 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  55.2 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  53.57 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  48.51 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  47.76 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  47.73 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  49.61 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  45.26 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  41.27 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  40.46 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  44.26 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  47.41 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  38.64 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  44.44 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  44.44 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  44.44 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  41.04 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  43.07 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  41.27 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  39.2 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  43.17 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  40.83 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  35.38 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  40.31 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  37.61 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  36.51 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  40.34 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  35.54 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.07 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.15 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.33 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.71 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.94 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.87 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.89 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  35 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  33.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.79 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.34 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.53 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32.8 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  33.81 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  31.82 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  32.86 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  30.77 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  30.23 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  31.88 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.63 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  29.91 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.64 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  30.4 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.56 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  28.68 
 
 		 155 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>