74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0529 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  100 
 
 		 164 aa  328  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  43.97 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0733  DoxX family protein  49.64 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.707851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  36.14 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  36.14 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  37.93 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.59 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  33.8 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  28.95 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.37 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  33 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  29.29 
 
 		 172 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.86 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.53 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  33 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  35.71 
 
 		 202 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  36.59 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  39.24 
 
 		 216 aa  47.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  27.89 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  25.42 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  36.11 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  26.92 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  36.11 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  36.11 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  35.42 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  30.61 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  30.56 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  30.14 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  28.03 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  35.62 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  38.46 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  29.13 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  33.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  33.67 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  39.62 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  39.62 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  28.29 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  33.67 
 
 		 197 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  28.29 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  34.18 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  32.93 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  26.83 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  25.69 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  30.47 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  35.21 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  30 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  31.97 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.62 
 
 		 131 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  31.08 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  34.21 
 
 		 136 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  30.23 
 
 		 137 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  30.23 
 
 		 135 aa  42  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  28.57 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  30.26 
 
 		 135 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  31.25 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  32.86 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  32.86 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  32.86 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  32.86 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  32.86 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  28.12 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  32.98 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  28.1 
 
 		 149 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  24.83 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  27.92 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  24.83 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  24.83 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  24.44 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  32.86 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  32.86 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  22.9 
 
 		 136 aa  40.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>