96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1342 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  100 
 
 		 145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  50.85 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  43.06 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  43.57 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  43.7 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  44.96 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  44.62 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  44.26 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  44.96 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  45.74 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  43.94 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  40.85 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  43.8 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  45.97 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  38.46 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  41.67 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  43.9 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  41.13 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  45.16 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  41.32 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  38.66 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  42.64 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  36.92 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  36.62 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  40 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  44 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  44 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  44 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  38.93 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  44.71 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  40.87 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  35.66 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  42.28 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  37.4 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  38.17 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  39.5 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  39.23 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  37.21 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  38.98 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  40.52 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  42.74 
 
 		 185 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  37.4 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  36.09 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  37.01 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  37.8 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  32.31 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.37 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  35.48 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.71 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.88 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.16 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  29.92 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30.95 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.52 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  33.33 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  27.91 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  29.13 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  34.13 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  34.81 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  31.62 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  32.85 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.67 
 
 		 730 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.07 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  34.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.67 
 
 		 752 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  31.09 
 
 		 160 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  35.51 
 
 		 144 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  31.09 
 
 		 160 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  37.97 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  31.09 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  31.15 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  31.15 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  31.09 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  30.77 
 
 		 738 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  36.36 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  31.54 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  31.54 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  31.54 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  31.78 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  31.09 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  31.09 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  31.09 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  31.78 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  34.07 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  30.71 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  29.92 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  27.05 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  29.41 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  32.98 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  29.41 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  29.41 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.07 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  31.01 
 
 		 147 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  26.67 
 
 		 130 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>