104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2710 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  393  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  88.32 
 
 		 197 aa  347  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  87.82 
 
 		 197 aa  346  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  84.77 
 
 		 197 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  87.31 
 
 		 202 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  85.79 
 
 		 197 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  85.28 
 
 		 197 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  85.28 
 
 		 197 aa  333  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  76.29 
 
 		 198 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  75.66 
 
 		 198 aa  296  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  73.06 
 
 		 197 aa  288  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  72.19 
 
 		 197 aa  283  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  79.06 
 
 		 196 aa  274  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  75.66 
 
 		 195 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  75.56 
 
 		 196 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  60.5 
 
 		 216 aa  251  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  62.9 
 
 		 196 aa  230  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  61.29 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  56.5 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  59.79 
 
 		 199 aa  211  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  46.15 
 
 		 232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32.4 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  30.9 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  42.86 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  43.33 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  35.56 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  35.56 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  38.05 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  37.04 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.13 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  29.19 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  36.11 
 
 		 148 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  33.67 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  38.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.14 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  37.76 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  35.42 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  39.78 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.74 
 
 		 134 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  34.38 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  34.38 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  42.42 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  42.86 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.58 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.19 
 
 		 149 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  36.9 
 
 		 137 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  34.29 
 
 		 141 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  37.93 
 
 		 135 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  41.24 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  34.07 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  34.07 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  43.75 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  31.86 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  31.86 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  40.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  40.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  37.08 
 
 		 136 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  40.62 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  36.14 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  36.71 
 
 		 123 aa  46.2  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  28.47 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  42.86 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  35.85 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  33.33 
 
 		 137 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  41.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.29 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.76 
 
 		 127 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  34.69 
 
 		 147 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  34.69 
 
 		 174 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  40.95 
 
 		 150 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  33.02 
 
 		 148 aa  44.7  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  42.11 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  30.98 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  30.11 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  30.87 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  33.67 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  42.11 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  38.2 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  38.03 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  34.57 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  36.73 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  33.67 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  35.37 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  34.65 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.69 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4028  DoxX family protein  32.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  36.49 
 
 		 172 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  30.39 
 
 		 147 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  42  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  27.6 
 
 		 152 aa  42  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  33.67 
 
 		 173 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  33.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  33.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  49.06 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  34.52 
 
 		 137 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>