70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1839 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  94.39 
 
 		 196 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  76.53 
 
 		 199 aa  288  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  63.44 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  62.37 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  64.52 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  63.98 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  63.98 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  62.16 
 
 		 202 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  58.46 
 
 		 197 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  61.29 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  63.01 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  61.71 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  57.53 
 
 		 197 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  53.89 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  61.29 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  59.39 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  59.57 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  60.89 
 
 		 196 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  51.72 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  42.6 
 
 		 232 aa  158  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.87 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  32.61 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.99 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.33 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.46 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  34.54 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  38.04 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  38.04 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  36.96 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.16 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28.81 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  40.96 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  33.52 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  28.49 
 
 		 148 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  30.81 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  36.08 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  39.13 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  38.04 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  33.64 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  33.64 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  40.4 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  38.46 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.59 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  33.77 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  36.17 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.31 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.57 
 
 		 147 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.63 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  32.35 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  29.76 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  28.06 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  37.27 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.21 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  37.78 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.87 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  33.33 
 
 		 127 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  40.4 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  40.4 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  40.4 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  43.48 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  31.15 
 
 		 147 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  31.15 
 
 		 147 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  31 
 
 		 147 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  39.62 
 
 		 169 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>