76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1739 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  77.72 
 
 		 198 aa  308  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  75.92 
 
 		 197 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  76.19 
 
 		 197 aa  294  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  78.41 
 
 		 198 aa  289  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  70.98 
 
 		 197 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  70.98 
 
 		 202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  70.47 
 
 		 197 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  69.23 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  69.23 
 
 		 197 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  77.13 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  69.23 
 
 		 197 aa  267  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  68.72 
 
 		 197 aa  267  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  75.14 
 
 		 197 aa  253  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  73.54 
 
 		 196 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  59.7 
 
 		 204 aa  241  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  59.89 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  61.24 
 
 		 196 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  60.89 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  59.24 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  43.89 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  27.75 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  29.94 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  46 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.53 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  36.56 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.59 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  39.19 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.59 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  37.33 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.02 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  37.33 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  30.51 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  37.36 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  41.05 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  37.36 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  35.16 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  26.15 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.34 
 
 		 134 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  26.37 
 
 		 146 aa  48.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  45.83 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  35.79 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  32.26 
 
 		 127 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  35.87 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  34.57 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  35.16 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  28.09 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  38.89 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  38.71 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.03 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.41 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  38.55 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  34.58 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  35.48 
 
 		 143 aa  45.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  26.8 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.09 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  34.52 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.11 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  42.59 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  35.29 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  33.33 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.26 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.71 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  28.24 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  28.24 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  35.29 
 
 		 166 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  31.4 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.94 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  40.79 
 
 		 131 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  31.11 
 
 		 123 aa  41.6  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  24.31 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  38.95 
 
 		 146 aa  41.2  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  29.82 
 
 		 141 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>