39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2586 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  46.3 
 
 		 197 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  47.73 
 
 		 197 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  46.88 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  47.51 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  49.09 
 
 		 197 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  44.44 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  45.98 
 
 		 197 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  48.18 
 
 		 197 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  46.88 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  48.18 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  46.54 
 
 		 204 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  48.29 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  45.21 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  46.15 
 
 		 197 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  42.99 
 
 		 196 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  43.05 
 
 		 196 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  42.6 
 
 		 196 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  45.66 
 
 		 195 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  44 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  42.86 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  44.87 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  44 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  42.11 
 
 		 144 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  28.81 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  29.81 
 
 		 133 aa  45.4  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  41.05 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  33.98 
 
 		 147 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  29.81 
 
 		 133 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  38.89 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  36.36 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  36.36 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.77 
 
 		 133 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  38 
 
 		 145 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  31.13 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  47.27 
 
 		 147 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  43.08 
 
 		 164 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  34 
 
 		 143 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>