97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1616 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1616  DoxX  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  64.29 
 
 		 204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  62.5 
 
 		 197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  62.56 
 
 		 202 aa  251  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  62.07 
 
 		 197 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  62.07 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  63.02 
 
 		 197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  63.02 
 
 		 197 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  63.02 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  58.76 
 
 		 197 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  59.6 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  58.33 
 
 		 197 aa  232  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  59.47 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  60.5 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  59.89 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  61.73 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  61.96 
 
 		 196 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  54.4 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  53.89 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  53.73 
 
 		 199 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  45.21 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.69 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  42.86 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.98 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.73 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  44.44 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  37.63 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  42.7 
 
 		 134 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  34.02 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  34.02 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  43.69 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  39.02 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  36.67 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.61 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  35.78 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.42 
 
 		 148 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  33 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  34.55 
 
 		 137 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.63 
 
 		 154 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  31.87 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  35.79 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  28.42 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  31.87 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  37.76 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  36.97 
 
 		 139 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  37.04 
 
 		 137 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  38.82 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  42.86 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  39.19 
 
 		 133 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.73 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  41.24 
 
 		 149 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.74 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  40.23 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.89 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  37.63 
 
 		 143 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  33.64 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  39.24 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  37.97 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  46.15 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  46.15 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  46.15 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.67 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  39.58 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  29.77 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  37.08 
 
 		 136 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  39.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.89 
 
 		 147 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  28.57 
 
 		 143 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  36.71 
 
 		 155 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  39.24 
 
 		 143 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.04 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  35 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  38.89 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  35.19 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  39.68 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  39.68 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  31.63 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  38.96 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  32.1 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  33.96 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.31 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  30.23 
 
 		 172 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  26.32 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  37.23 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  48.78 
 
 		 123 aa  42  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  34.55 
 
 		 170 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  29.79 
 
 		 149 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  36.11 
 
 		 173 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.71 
 
 		 144 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  39.8 
 
 		 150 aa  41.6  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  29.41 
 
 		 144 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  48.08 
 
 		 136 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>