62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3790 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  46.1 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  41.29 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  46.77 
 
 
172 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  40.65 
 
 
183 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  38.85 
 
 
183 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  40.14 
 
 
182 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  37.65 
 
 
185 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  44.09 
 
 
185 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  45.45 
 
 
172 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  38.52 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  38.1 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  37.12 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  37.01 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  38.1 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  37.3 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  37.01 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  35.54 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  35.82 
 
 
141 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  37.9 
 
 
133 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  32.65 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  36.92 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  28.79 
 
 
139 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.07 
 
 
148 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  38.14 
 
 
143 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  35.2 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  31.16 
 
 
198 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  32.56 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  39.24 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.56 
 
 
134 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  28.8 
 
 
133 aa  48.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  29.93 
 
 
137 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  28.89 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  28 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  31.43 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  28 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  32.91 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  30.25 
 
 
131 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  33.33 
 
 
135 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  31.54 
 
 
140 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  35 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  30.51 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  32.03 
 
 
132 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  28.69 
 
 
145 aa  44.7  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  34.58 
 
 
137 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  35 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  36.84 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3120  hypothetical protein  35.83 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.17 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3850  DoxX family protein  35.83 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  35.11 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  28.36 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  29.17 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  28.74 
 
 
131 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  30 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  33.33 
 
 
149 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  37.97 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2386  DoxX family protein  28.68 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  34.18 
 
 
197 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  34.04 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  25.98 
 
 
125 aa  41.2  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  29.57 
 
 
143 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>