57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0684 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  100 
 
 		 137 aa  265  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  59.68 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  57.81 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  57.81 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  54.4 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  54.47 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  55.65 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  54.4 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  51.56 
 
 		 135 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  51.54 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  51.52 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  54.14 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  51.69 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  53.39 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  51.97 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  49.6 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  48.85 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  46.46 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  54.24 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  43.94 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  50 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  44.44 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  52.46 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  47.58 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  50.38 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  52.94 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  47.73 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  42.31 
 
 		 136 aa  96.7  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  50 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  42.64 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  40.44 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  42.64 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  44.17 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  38.52 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  40 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  41.04 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  41.04 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  41.04 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  42.4 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  39.17 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  35.61 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  34.85 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  39.5 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  38.57 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  40.98 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  33.93 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.5 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.04 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  32.28 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  29.93 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  34.43 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.06 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.72 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32.59 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.59 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>