46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6801 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  73.13 
 
 		 136 aa  203  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  73.33 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  69.12 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  51.85 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  53.38 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  51.2 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  52.21 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  47.73 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  51.59 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  50.79 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  48.85 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  48.85 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  46.51 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  46.97 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  46.67 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  50 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  45.6 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  49.58 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  48.48 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  48.82 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  50.41 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  46.4 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  45.11 
 
 		 133 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  40.44 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  39.57 
 
 		 136 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  44.85 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  38.46 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  38.1 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  37.9 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  38.81 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  38.81 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  38.81 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  35.77 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  37.7 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  36.96 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  35.34 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  35.77 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  36.09 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  37.19 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  39.32 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  32.62 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  34.06 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  36.09 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  37.23 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  33.59 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>