64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1219 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  100 
 
 
156 aa  308  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  68.38 
 
 
147 aa  200  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  65.07 
 
 
150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  46.81 
 
 
143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  50.38 
 
 
143 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  49.32 
 
 
153 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  44.37 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  47.29 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  43.57 
 
 
145 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  45.53 
 
 
153 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  41.54 
 
 
133 aa  95.5  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  40.46 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  46.34 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  42.31 
 
 
180 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  42.31 
 
 
180 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  42.31 
 
 
180 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  40.3 
 
 
135 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  42.96 
 
 
185 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  40.98 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  40.16 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  41.35 
 
 
136 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  40.16 
 
 
133 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  39.34 
 
 
133 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  42.86 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  36.52 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  40.98 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  36.69 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  35.38 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  42.62 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  34.35 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  36.92 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  37.4 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  34.13 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  34.85 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  38.89 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  35.48 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  33.62 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  43.21 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  41.67 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  35 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  34.62 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  32.62 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  41.25 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  37.07 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  31.11 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  34.4 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  32.58 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  32.12 
 
 
144 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  29.85 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  31.82 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  31.82 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  25.9 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.84 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  28 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.68 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.93 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  27.97 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.16 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  30.65 
 
 
148 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  29.21 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  30.49 
 
 
137 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.25 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>