79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7016 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  100 
 
 		 153 aa  303  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  71.43 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  72.93 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  50 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  50.4 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  45.99 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  45.9 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  45.53 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  42.74 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  38.46 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  37.96 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  41.67 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  41.67 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  41.67 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  39.86 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  45.53 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  38.84 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  39.69 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  38.21 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  40 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  36.15 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  38.02 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  38.66 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  38.02 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  36.57 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  33.83 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  36.44 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  38.52 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  35.54 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  36.21 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  37.07 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  34.4 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  35.77 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  36.72 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  35.2 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  39.5 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.14 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  33.58 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  35.43 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  37.82 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  34.38 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  39.06 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  38.4 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  35.2 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  33.61 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32.8 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.87 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  32.89 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.52 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.86 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  33.82 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.56 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.82 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.82 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  31.88 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  32.52 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  33.6 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  34.07 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  32.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  29.58 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.65 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  34.59 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  30.94 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  32.31 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  34.68 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  30.66 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  27.61 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  31.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  28.68 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.93 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  29.22 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  30.83 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  27.78 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>