101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0934 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0934  DoxX  100 
 
 		 140 aa  277  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  64.34 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  62.79 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  58.14 
 
 		 134 aa  163  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  63.08 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  63.08 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  59.23 
 
 		 130 aa  149  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  60.48 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  57.14 
 
 		 130 aa  140  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  56.39 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  61.54 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  54.89 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  56.67 
 
 		 136 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  57.14 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  53.68 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  52.99 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  54.4 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  51.22 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  50.36 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  50.82 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  58.4 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  50 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  51.52 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  47.01 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  46.27 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  44.44 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  51.52 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  46.32 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  51.4 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  44 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  48.48 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  48.82 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  43.94 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  45.52 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  45.52 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  45.52 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  46.85 
 
 		 161 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  44.44 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  38.57 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  45.22 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  38.89 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  40.46 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  39.06 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  36.69 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  38.3 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.42 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  33.58 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.43 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  34.48 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.94 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.4 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  38.33 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.5 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.88 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.14 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.87 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  34.71 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.06 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.58 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  32.14 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  32.14 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  31.88 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  36.89 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  36.27 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  29.08 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.81 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  30.23 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  30.36 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  30.36 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  34.31 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  31.01 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  31.54 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  31.45 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  33.67 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  33.07 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  29.46 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  33.08 
 
 		 154 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  29.37 
 
 		 279 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  31.43 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  33.61 
 
 		 140 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  29.91 
 
 		 131 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  34.78 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  31.34 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  33.63 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  29.85 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  39.71 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  35.29 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  35.29 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  35.29 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  26.83 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  34.43 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  39.71 
 
 		 198 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>