93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0230 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  76.3 
 
 		 133 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  51.24 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  44.09 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  42.75 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  44.44 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  48 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  41.61 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  40.94 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  45.24 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  40.91 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  40.15 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  42.74 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  41.88 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  42.31 
 
 		 137 aa  96.7  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  42.97 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  38.64 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  41.86 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  44.19 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  44.19 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  44.19 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  38.21 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  41.35 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  43.8 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  43.33 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  40.62 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  39.57 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  44.17 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  45 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  35.43 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  39.32 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  40 
 
 		 161 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  41.18 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  40.44 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  40.85 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  42.74 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  39.86 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  42.97 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  45.31 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  41.79 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  40 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  44.07 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  36.88 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  42.98 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  42.4 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  38.93 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.88 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  35.2 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32.31 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.16 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  36.05 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  32.35 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.43 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  29.45 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  29.41 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.48 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  27.66 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  36 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  36 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  30.53 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  28.26 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  30.65 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  28.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  28.68 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  29.55 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.91 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  35.43 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  28.35 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  32.91 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  32.14 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  32.91 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  35.87 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  27.2 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  33.33 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  32.91 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  32.41 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  27.59 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  29.17 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  32.18 
 
 		 172 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  28.89 
 
 		 164 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2386  DoxX family protein  29.58 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  31.9 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  30.43 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  34.18 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>