112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1443 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  100 
 
 		 137 aa  258  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  68.61 
 
 		 137 aa  166  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  53.28 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  54.1 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  52.85 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  43.94 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  47.33 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  57.52 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  44.53 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  43.51 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  48.76 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  45.76 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  45.83 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  43.22 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  42.5 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  48.7 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  43.65 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  44.17 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  42.37 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  43.33 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  38.93 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  47.29 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  50.93 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  45.04 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  44.54 
 
 		 131 aa  96.7  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  39.1 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  39.17 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  34.96 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  42.62 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  36.29 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  34.35 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  31.78 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  38.98 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  32.74 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.09 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.2 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.33 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  29.77 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  36.97 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  34.15 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  30.13 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  31.78 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  37.93 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  30.13 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  35.14 
 
 		 279 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  35.48 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  36.73 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  36.73 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  32.64 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  32.85 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  36.73 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  34.35 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  33.61 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  32.54 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.75 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  30.95 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  30.43 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  30.95 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  30 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  33.33 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  37.8 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  34.88 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  31.78 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  33.78 
 
 		 297 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  31.01 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  31.62 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  32.58 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  28.06 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  31.9 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  34.92 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  30.53 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  25.36 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  28.36 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  25.36 
 
 		 177 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  30.95 
 
 		 188 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  28.46 
 
 		 141 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  34.21 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  32.56 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  32.56 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  32.56 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  43.75 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  31.01 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  35.63 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  31.09 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  32.81 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  34.09 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  39.58 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  29.2 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>