70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0728 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  269  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  68.84 
 
 
149 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  67.16 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  61.59 
 
 
138 aa  174  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  66.42 
 
 
150 aa  166  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  60 
 
 
140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  47.58 
 
 
131 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  44.88 
 
 
128 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  50.79 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  45.11 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  46.56 
 
 
157 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  45.16 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  43.8 
 
 
144 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  39.23 
 
 
144 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  42.97 
 
 
143 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  41.13 
 
 
130 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  43.51 
 
 
134 aa  110  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  37.69 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  47.37 
 
 
131 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  45.69 
 
 
131 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  39.06 
 
 
143 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  39.06 
 
 
143 aa  103  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  45.05 
 
 
114 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  43.41 
 
 
134 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  36.72 
 
 
140 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  42.4 
 
 
127 aa  100  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  40.31 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  44.14 
 
 
137 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  43.55 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  43.51 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  35 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  33.87 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  35.96 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.35 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.28 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.81 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  31.82 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  32.82 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  32.82 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  32.82 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.9 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  26.5 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  31.25 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  32.09 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  29.69 
 
 
186 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  30.47 
 
 
186 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.2 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  31.43 
 
 
143 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  28.35 
 
 
154 aa  47  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  31.4 
 
 
131 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  33.1 
 
 
297 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  31.47 
 
 
296 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  32.03 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.77 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  32.64 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  30.65 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  25.98 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  32 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  32 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  28.12 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.59 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  28.89 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  31.58 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  40.3 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  31.97 
 
 
148 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  28.68 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.85 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.59 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>