75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0183 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  100 
 
 
127 aa  253  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  52.8 
 
 
132 aa  124  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  57.36 
 
 
129 aa  124  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  43.75 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  45.24 
 
 
128 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  43.75 
 
 
137 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  41.6 
 
 
138 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  40.31 
 
 
134 aa  101  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  40.48 
 
 
140 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  41.6 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  40.65 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  38.21 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  38.28 
 
 
143 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  36.92 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  37.3 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  36.15 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  40.87 
 
 
131 aa  87  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  37.69 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  35.2 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  33.6 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  33.87 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  41.27 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  35.94 
 
 
144 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  35.71 
 
 
144 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  34.38 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  33.87 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  36.92 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  38.68 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  40.91 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  33.08 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  38.1 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  34.88 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.1 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  34.26 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  35.4 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  35.56 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  36.29 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  30.23 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  27.41 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  29.27 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  35.56 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.82 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  43.4 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4497  DoxX family protein  35.29 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  30.3 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  32.09 
 
 
279 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.52 
 
 
146 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  29.6 
 
 
188 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.59 
 
 
149 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  26.56 
 
 
190 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  31.88 
 
 
378 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  26.15 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  28.68 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  25.81 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  27.06 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  39.62 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  26.67 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>