134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0556 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  32.62 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  32.86 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.86 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  33.58 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  34.29 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  33.09 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.84 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  33.79 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  35.56 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  32.59 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  34.06 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  34.31 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  35.63 
 
 		 379 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  31.11 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  38 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  31.06 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  33.58 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  31.43 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  31.62 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  31.62 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  33.88 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  34.75 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  33.61 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  38.96 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  34.85 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  34.65 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  30.71 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  34.56 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  35.56 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.2 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  36.11 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  30.71 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  30.5 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  30.71 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  30.71 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  34.33 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  30.71 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  34.85 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  30.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  30.71 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  29.37 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  31.09 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  29.84 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  32.35 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  33.9 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  34.07 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  38.36 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.66 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  32.35 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  38.36 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  30.66 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  32.12 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  32.12 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  32.12 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  32.12 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  36.11 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  33.33 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30.15 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  37.68 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  32.12 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  32.12 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  32.12 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  32.12 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  26.09 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  32.12 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  31.62 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  33.09 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  30.15 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  31.93 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3393  DoxX family protein  30.07 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  31.93 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  34.25 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  31.93 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  26.71 
 
 		 315 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  34.72 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  30.77 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  36.76 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  36.76 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  30.07 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  36.76 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  33.33 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  33.06 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  30.56 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  33.06 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  33.06 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  33.06 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  29.2 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  36.99 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  29.37 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  35 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  37.33 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  34.07 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  31.71 
 
 		 276 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  33.06 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>