187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2327 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2327  DoxX  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  35.07 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  41.6 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  34.85 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3329  hypothetical protein  46.67 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  32.84 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.33 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  37.01 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.81 
 
 		 136 aa  85.5  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  40.3 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  36.76 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  36.51 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  37.31 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  36.36 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  38.64 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  37.01 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  38.93 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  37.01 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  38.93 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  38.93 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  36.04 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  38.93 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.68 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  32.33 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  37.12 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  40.32 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  32.31 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  37.12 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  37.12 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  37.72 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  37.12 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  37.12 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  37.12 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  37.12 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  37.12 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  31.54 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  38.46 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  36.36 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  36.64 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  33.58 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  40 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  36.75 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  36.84 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  32.84 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  38.1 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  26.92 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  30.23 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  30.23 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  35.4 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  26.92 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.56 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  31.88 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  32 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  32 
 
 		 164 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  32 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  32 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  32.8 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.6 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  32 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  32 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  32.56 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  32 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  32 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  35.4 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  35.4 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  31.01 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  34.19 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  33.33 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  36.28 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  31.25 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  32.31 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  32.52 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  30.97 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  33.63 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  33.63 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  33.63 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  31.45 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  27.78 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  30.7 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  31.01 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  34.78 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  25.95 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  36.3 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  27.68 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  31.01 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  32.48 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  31.75 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  34.78 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  34.78 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  32.48 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  38.35 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  32.82 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>