69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2855 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  100 
 
 		 379 aa  729    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  46.11 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  46.11 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  46.11 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  46.5 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  44.36 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  52.82 
 
 		 182 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  52.41 
 
 		 174 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  34.94 
 
 		 271 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  43.42 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  51.02 
 
 		 181 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  51.72 
 
 		 181 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  38 
 
 		 236 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  43.15 
 
 		 182 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  42.76 
 
 		 182 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  43.09 
 
 		 119 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  45.14 
 
 		 176 aa  99.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  34.97 
 
 		 226 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  44.97 
 
 		 223 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  46.61 
 
 		 130 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  38.67 
 
 		 161 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  40.14 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  34.81 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  36.03 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  35.86 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  35.37 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  45.13 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  43.48 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  42.65 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  35.96 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  42.65 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  34.85 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  39.71 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  35.63 
 
 		 145 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  33.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  30.43 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  34.59 
 
 		 136 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1397  hypothetical protein  24.34 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0479403  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  29.66 
 
 		 139 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  30.83 
 
 		 151 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  34.21 
 
 		 137 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  33.06 
 
 		 136 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  32.94 
 
 		 137 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  31.39 
 
 		 143 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  37.14 
 
 		 137 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  33.09 
 
 		 131 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  32.22 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  32.56 
 
 		 136 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  38.1 
 
 		 146 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  32.86 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  33.8 
 
 		 136 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  33.33 
 
 		 121 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  30.67 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  38.24 
 
 		 150 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1394  protein of unknown function DUF883, ElaB  33.94 
 
 		 142 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  29.5 
 
 		 146 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  31.4 
 
 		 142 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  31.4 
 
 		 137 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  36.62 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  30.17 
 
 		 149 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  31.4 
 
 		 137 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  41.82 
 
 		 135 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  32.89 
 
 		 145 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  32.89 
 
 		 135 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  29.6 
 
 		 129 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>