22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19460 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  376  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  35.37 
 
 
379 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  32.19 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  34.24 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  35.76 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  35.76 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  35.76 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  31.94 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  37.28 
 
 
223 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  34.39 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  29.63 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  29.22 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  30.65 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  28.29 
 
 
271 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  28.93 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  28.19 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  39.16 
 
 
176 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  33.73 
 
 
181 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  29.28 
 
 
238 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  33.55 
 
 
181 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  26.9 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  28.12 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>