20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1811 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  43.36 
 
 
192 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  37.76 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  33.94 
 
 
182 aa  87  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  38.51 
 
 
379 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  34.13 
 
 
321 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  34.13 
 
 
321 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  34.13 
 
 
321 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  32.05 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  31.54 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  33.55 
 
 
315 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  32.64 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  30.87 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  35 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  30 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  27.85 
 
 
238 aa  54.3  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  30.52 
 
 
174 aa  53.9  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  37.84 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  31.58 
 
 
182 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  28.19 
 
 
188 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>