42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2562 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  100 
 
 		 321 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  100 
 
 		 321 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  100 
 
 		 321 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  70.29 
 
 		 315 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  76.02 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  42.26 
 
 		 379 aa  232  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  43.75 
 
 		 174 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  41.55 
 
 		 182 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  31.45 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  38.56 
 
 		 238 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  42.55 
 
 		 181 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  41.5 
 
 		 181 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  36.99 
 
 		 236 aa  92.8  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  38.19 
 
 		 176 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  36.67 
 
 		 182 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  34.06 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  36.89 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  34.13 
 
 		 161 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  33.77 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  39.72 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  44.35 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  35.76 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  35.29 
 
 		 175 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  35.85 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  29.89 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1394  protein of unknown function DUF883, ElaB  40.23 
 
 		 142 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  31.08 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  39.13 
 
 		 137 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  32.22 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  39.71 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  35.71 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  31.11 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  34.12 
 
 		 137 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  31.52 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  30.51 
 
 		 130 aa  46.2  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  36.25 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  29.08 
 
 		 150 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  37.66 
 
 		 139 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  34.88 
 
 		 136 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  34.67 
 
 		 134 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  27.54 
 
 		 145 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  32.94 
 
 		 137 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>