82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1701 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  100 
 
 		 174 aa  340  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  52.82 
 
 		 379 aa  154  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0449  DoxX family protein  56.83 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2562  DoxX family protein  43.75 
 
 		 321 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2554  DoxX family protein  43.75 
 
 		 321 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2517  DoxX  43.75 
 
 		 321 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39020  predicted membrane protein  41.24 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3130  DoxX family protein  40.14 
 
 		 315 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.470972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4544  DoxX family protein  46.15 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3403  DoxX family protein  40.97 
 
 		 276 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351564  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  48.05 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2385  DoxX family protein  38.64 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  40.51 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2652  DoxX family protein  37.65 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000120854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0296  DoxX family protein  41.84 
 
 		 271 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1210  DoxX family protein  38.12 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  38.16 
 
 		 226 aa  94  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  40.62 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1264  DoxX family protein  37.5 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  0.163775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  40 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09480  hypothetical protein  37.84 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  41.98 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  35.23 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  33.08 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  30.33 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  41.46 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  36.67 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1811  hypothetical protein  30.52 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  33.87 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  33.06 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  29.84 
 
 		 145 aa  51.2  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.29 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1208  DoxX family protein  29.34 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  40.32 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  30.87 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.29 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0545  hypothetical protein  30.66 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3712  DoxX family protein  39.47 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.803576  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19460  hypothetical protein  28.93 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  34.44 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  26.52 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  34.38 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  31.45 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  37.88 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  30.56 
 
 		 140 aa  47.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2493  DoxX family protein  31.54 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3994  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.47 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.47 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  34.15 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30.69 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  32.23 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  32.5 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  32.5 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  32.43 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  33.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  34.91 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  31.25 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  28.08 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  32.93 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  30.52 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  31.25 
 
 		 135 aa  44.3  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  26.47 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  27.91 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  32.74 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  28.57 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  29.75 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  29.6 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  30.23 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  36.23 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  32.95 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  36.23 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11793  hypothetical protein  29.46 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  34.57 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  38.33 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  31.71 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  33.33 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  34.78 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  37.5 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  30 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>